В школе имеется столовая с обеденным залом на 80 посадочных мест. С 1 сентября 2020 года все обучающиеся 1-4 классов получают бесплатное горячее питание. В МКОУ "Макушинская СОШ" № 2 созданы условия для организации горячего питания обучающихся, в том числе, инвалидов и лиц с ограниченными возможностями здоровья: имеется обеденный зал, помещения для хранения и приготовления пищи. Обучающиеся школы обеспечиваются питанием в соответствии с утвержденными нормами и методическими рекомендациями по организации питания. При организации питания школа руководствуется санитарно - эпидемиологическими требованиями, предъявляемыми к организациям общественного питания, изготовлению и оборотоспособности в них продовольственного сырья и пищевых продуктов, к условиям, срокам хранения особо скоропортящихся продуктов, к организации рационального питания обучающихся в общеобразовательных учреждениях. Организатором питания в МКОУ "Макушинская СОШ" №2 является потребительский кооператив "Макушинский районный союз потребительских обществ". Организатором питания в Макушинской основной общеобразовательной школе - филиал МКОУ "Макушинская СОШ" №2 является потребительский кооператив "Макушинский районный союз потребительских обществ".
Контроль за качеством питания возложен на социальных педагогов образовательной организации. Проводится контроль сырой и готовой продукции, оставляется проба готовой продукции на 48 часов, ведется бракеражный журнал готовой продукции. Питание проводится по 10-ти дневному циклическому меню.